Etter at røde blodlegemer har fullført levetiden, brytes de ned av leveren og milten. Hemoglobinet frigjøres fra de røde blodcellene og brytes ned til bilirubin. Bilirubin blir deretter transportert til tarmene, hvor det omdannes til stercobilin av bakterier.
Stercobilin er ansvarlig for den karakteristiske brune fargen på avføring. Mengden stercobilin som produseres kan variere avhengig av faktorer som kosthold og mengden galle som produseres av leveren. Visse matvarer, som rødt kjøtt og rødbeter, kan også påvirke fargen på avføring.
I tillegg til stercobilin kan avføring også inneholde andre pigmenter som kan bidra til fargen, som urobilin og koproporfyrin. Disse pigmentene dannes også ved nedbrytning av hemoglobin.