Begravelse i massegraver var den vanligste måten å kvitte seg med de døde på under svartedauden. Massegraver ble ofte gravd utenfor bymurene for å hindre spredning av sykdom. I noen tilfeller var groper så dype at de kunne holde tusenvis av kropper.
Pestgroper
Pestgroper var en annen vanlig metode for kroppsdeponering under svartedauden. Pestgroper var store, dype hull som var fylt med kalk og vann. Kalken ville bidra til å bryte ned kroppene og forhindre spredning av sykdom.
Brennende kropper
I noen tilfeller ble kropper brent for å hindre spredning av sykdom. Denne praksisen ble ofte brukt i områder der massegraver eller pestgroper ikke var tilgjengelige eller hvor antallet kropper var for stort til å kunne begraves.