Genotyping Tools

Genetiske forskere har kombinert arbeidet med å avgjøre hele genetiske sekvensen , 9 milliarder baser , som finnes i det menneskelige genom . Genomet er DNA-innhold som finnes i ethvert menneske celle består av å gjenta nitrogenbaser merket som " A ", " G ", " C" og " T. " Genetics forskning fortsetter å lete etter variasjonen i forskjellige humane genom så vel som forskjellige arter av evolusjonsstudier . Medisinsk genetiske studier er interessert i å finne genetiske misdannelser eller genetisk variasjon som kan forårsake sykdom . Genotyping er en metode for bestemmelse av genetisk variasjon uten å sekvensere hele genomet . Forskere isolere små områder av et genom for å se etter størrelsesforskjeller , et resultat av forskjellige antall nitrogenbaser . Forskjellige basetall kan være forårsaket av en genetisk abnormitet som resulterer i sykdommer så som diabetes, Alzheimers sykdom og cancer. Verktøyene som brukes til å utføre genotyping programmer har utviklet seg og utviklet for å raskt og nøyaktig bestemme en individuell genotype . Den Polymerase Chain Reaction

Utviklingen av genteknologi stammer fra utviklingen av Polymerase Chain Reaction , eller PCR . Denne metoden gjør det mulig for forskere å forsterke eller lage kopier av små regioner i et genom i løpet av timer . Regionen av interesse bestemmes ved tilsetning av korte DNA- molekyler --- primere som samsvarer med begynnelsen og slutten av regionen av interesse . Har

PCR blitt et uvurderlig verktøy i genetisk forskning . Forsterke den samme regionen fra forskjellige individer tilveiebringer en metode for sammenligning. Forensics identifikasjon bruker i dag 15 separate områder for sammenligning. En region kan matche i forskjellige mennesker . Imidlertid bør ikke to mennesker matche alle 15 regioner .
Agarosegelelektroforese

PCR er en metode for å forsterke bestemte regioner av DNA . Men det gir ikke en metode for å sammenligne faktiske størrelsen på fragmentene . Produkter av PCR blir separert etter størrelse ved hjelp av en gel -lignende materiale som kalles " agarose . " Mindre fragmenter vandrer raskere på tvers av agarose som svar på en elektrisk strøm i en prosess som kalles " agarosegelelektroforese . "

Etter PCR fragmentene er lastet på agarose og vandrer langs gel når elektrisk strøm tilføres . Etidiumbromid tillater fragmenter å bli sett når under ultrafiolett lys . Agarosegelelektroforese tilveiebringer en fremgangsmåte for hurtig bestemmelse av vellykkede PCR samt tilnærmet fragment størrelse. Imidlertid er ulempen med agarose som et verktøy for genotyping at fragmentene må være vesentlig forskjellig i størrelse for nøyaktige resultater. Agarose gir ikke et godt medium for å sammenligne fragmenter annerledes ved en enkelt base .

Automated sequencere og genetiske analysatorer
Fluorescent merket DNA- fragmenter registrert av en automatisert sequencer .

Automatiserte sequencere og genetiske analyser har blitt det viktigste verktøyet som brukes i genotyping . Disse tillater fragmenter , forskjellige av en enkelt nitrogenbasen , som skal bestemmes raskt og rimelig. Som ved agarose gel -elektroforese , er DNA-fragmenter først amplifisert ved PCR . Imidlertid er en primer merket med et fluorescerende fargestoff legge farge til fragment . Prøver ble separert i henhold til størrelse ved å migrere gjennom en gel -lignende polymer som reaksjon på en elektrisk strøm . Mindre fragmenter beveger seg raskere enn større fragmenter . Som fragmentene migrere mot slutten av polymeren , et digitalt kamera registrerer farge og sender informasjonen til en datamaskin for analyse. Automatisert sekvense utstyr brukes i dag i rettsmedisinske identifikasjon og farskap testing .
Next Generation sequencere også Bestem Genotyper

Neste generasjons sekvense instrumenter har raskt dukket opp under siden 2006 . Denne teknikken kombinerer PCR amplifikasjon og sekvensering sammen for å bestemme millioner av baser på en gang. Prosessen begynner med PCR; Imidlertid , er forskjellige primere bundet til perlene blandet i en reaksjons slik tusenvis av regioner som skal forsterkes på en gang .

Neste generasjon sequencers deretter separere fragmentene etter størrelse , og at en mengde av DNA- regioner som skal analyseres. Fremgangsmåten er ufordelaktig som genotyping verktøy når forskere er interessert i å sammenligne en enkelt region av genomet . Fordelen er at genomet isolert fra en enkelt celle gir tilstrekkelig materiale for PCR amplifikasjon . Sammenligning av genotyper av normale og unormale celler isolert fra en enkeltperson kan bidra til å identifisere kreftceller og potensielle behandlinger .