Navnet "Medusa" antas å komme fra det greske ordet "medein", som betyr "å herske eller beskytte." Dette skyldes sannsynligvis Medusas rolle som en beskytter og vokterfigur i gresk mytologi. I tillegg kan navnet "Medusa" også være avledet fra det greske ordet "medomai", som betyr "å tenke eller vurdere." Dette kan referere til Medusas kloke og utspekulerte natur, så vel som hennes evne til å gjøre mennesker til stein med et enkelt blikk.
