Gardasil-vaksinen beskytter mot ni typer HPV:6, 11, 16, 18, 31, 33, 45, 52 og 58. Disse typene står for de fleste tilfeller av livmorhals-, vulva- og vaginal kreft, samt en stor andel tilfeller av anal- og orofaryngeal kreft. Det finnes imidlertid over 100 forskjellige typer HPV, og vaksinen gir ikke beskyttelse mot alle.
Etter vaksinasjon er det fortsatt viktig å praktisere sikker sex, inkludert bruk av kondom, for å redusere risikoen for infeksjon med HPV-typer som ikke dekkes av vaksinen. I tillegg anbefales vanlige Pap-tester eller HPV-tester for å screene for tilstedeværelse av HPV-infeksjon og for å oppdage eventuelle precancerøse endringer som kan utvikle seg.