Det latente stadiet av en infeksjonssykdom er forskjellig fra det patogene stadiet. Latent stadium refererer til en fase i løpet av en infeksjon, hvor patogenet vedvarer i verten, men ikke forårsaker noen aktive symptomer eller tegn på sykdom. Patogenet forblir i dvale eller i ro i vertens kropp, og etablerer ofte en langvarig, asymptomatisk infeksjon. I løpet av dette stadiet kan individet virke friskt og uvitende om å bære patogenet.
Derimot er det patogene stadiet fasen av en infeksjon hvor patogenet aktivt forårsaker symptomer og kliniske manifestasjoner av sykdommen. Dette stadiet er preget av tilstedeværelsen av tegn og symptomer forbundet med infeksjonen, ettersom patogenet multipliserer og samhandler med vertens immunsystem. Det patogene stadiet kan variere i alvorlighetsgrad, fra milde til alvorlige symptomer, og varigheten avhenger av det spesifikke smittestoffet, vertsfaktorene og effektiviteten til immunresponsen.
For eksempel, når det gjelder herpes simplex-virus (HSV), etter den første infeksjonen, kan viruset gå inn i et latent stadium hvor det forblir i dvale i sensoriske nerveganglier. Individet kan ikke oppleve noen symptomer i løpet av denne tiden. Imidlertid kan periodisk reaktivering av viruset føre til det patogene stadiet, noe som resulterer i dannelse av forkjølelsessår eller genital herpes, preget av smertefulle blemmer og lesjoner.
Skillet mellom det latente og patogene stadiet er viktig for å forstå dynamikken og persistensen til infeksjonssykdommer, samt utvikle strategier for forebygging, diagnose og behandling.