Symptomene på byllepest begynner vanligvis 2 til 7 dager etter bitt av en infisert loppe. I noen tilfeller kan det hende at symptomene ikke vises i opptil 14 dager. Symptomene på byllepest inkluderer:
* Feber og frysninger
* Hodepine
* Muskelsmerter
* Svakhet
* Kvalme og oppkast
* Diaré
* Hovne og smertefulle lymfeknuter (buboer)
Buboene er vanligvis plassert i lysken, armhulen eller nakken. De kan være veldig smertefulle og kan drenere puss. I alvorlige tilfeller kan buboene bli infisert og føre til sepsis.
Symptomene på byllepest kan vare i flere uker. I noen tilfeller kan pesten spre seg til blodet, forårsake septicemisk pest, eller til lungene, forårsake lungepest. Begge disse formene for pesten er mer alvorlige enn byllepest og kan være dødelige hvis den ikke behandles umiddelbart.