Sykdommene som herjet restene av Inkariket etter kontakt med de spanske conquistadorene på 1500-tallet inkluderer kopper, meslinger, influensa, tyfus og gul feber. Disse sykdommene var ødeleggende for den innfødte befolkningen fordi de nesten ikke hadde noen tidligere eksponering for disse sykdommene og derfor liten naturlig immunitet.
