Fargen på magesyre er ikke en pålitelig indikator på dens helse eller sammensetning. Magesyre er vanligvis klar eller svakt gul i fargen på grunn av tilstedeværelsen av saltsyre, som er fargeløs. Imidlertid kan fargen på magesyre variere avhengig av tilstedeværelsen av andre stoffer, for eksempel matpartikler, galle eller blod, som kan få det til å virke grønt, brunt eller rødt.
