Bakterier:
- Streptococcus pyogenes (strep hals)
- Staphylococcus aureus
- Streptococcus pneumoniae
- Haemophilus influenzae
- Mycoplasma pneumoniae
- Chlamydia pneumoniae
- Neisseria gonoré
Virus:
- Influensavirus (influensa)
- Parainfluensavirus
- Respiratorisk syncytialvirus (RSV)
- Adenovirus
- Herpes simplex-virus
- Epstein-Barr-virus
- Cytomegalovirus
Sopp:
- Candida albicans (trost)
Andre mikroorganismer:
- Mycoplasma hominis
- Ureaplasma urealyticum
Hvilken type mikroorganisme som forårsaker en halsinfeksjon vil avhenge av faktorer som personens alder, immunsystemstatus og eksponering for spesifikke patogener. Noen mikroorganismer er mer vanlige i visse geografiske områder eller på bestemte tider av året.