Flowcytometri er en teknikk som brukes til å analysere de fysiske egenskapene og kjemiske innholdet til biologiske celler når de strømmer i en enkelt fil gjennom en lysstråle. Cellene som brukes til flowcytometri er vanligvis farget med fluorescerende fargestoffer eller antistoffer som binder seg til spesifikke mål i cellene. Når de fargede cellene strømmer gjennom lysstrålen, sender de ut lyssignaler som oppdages og analyseres av flowcytometeret. De detekterte lyssignalene brukes deretter til å bestemme størrelsen, formen, granulariteten og andre fysiske egenskaper til cellene, samt tilstedeværelsen og konsentrasjonen av spesifikke målmolekyler i cellene.
Flowcytometri er en allsidig teknikk som brukes innen ulike felt av biologi, som blant annet immunologi, cellebiologi og kreftforskning. Den gir mulighet for rask, nøyaktig og multiparametrisk analyse av store cellepopulasjoner, og gir verdifull informasjon om celleadferd og egenskaper.