Protokollene som brukes i QSAR

QSAR står for kvantitativ struktur aktivitetsforhold . Brukt for å vise hvordan en kjemisk struktur kan kvantitativt korrelert til en bestemt prosess, er QSAR ofte brukt for å utforme medikamenter og narkotika . Denne metoden brukes til å veilede kjemisk syntese , som det finnes mange tusen forskjellige mulige strukturer for ett molekyl og forskere ellers kan kaste bort en masse tid på å teste hver enkelt struktur . Statistikk spille en viktig rolle i metodikken for QSAR . Multippel lineær regresjon

Multippel lineær regresjonsanalyse brukes når det er flere studier som brukes som alle er knyttet til en bestemt kjemisk struktur . En ligning er utviklet som , for eksempel, kan vise et forhold mellom redusere tumorstørrelse og tilstedeværelsen av en hydrofob gruppe på den fjerde posisjonen til en fenylring . Denne analysen reduserer mange forskjellige forbindelser slik at sammenhengen kan tolkes ved hjelp av bare et par parametere som er det viktigste .
Mønstergjenkjenning

Mønstergjenkjenning brukes til å definere parametre som resultat når bestemte kjemiske strukturer er gruppert sammen . Det finnes flere forskjellige typer av mønstergjenkjenning analyse , som inkluderer prinsipal komponent analyse , datamaskin automatiserte struktur evaluering og automatisert dataanalyse ved mønstergjenkjenning teknikker . Mønstergjenkjenning statistikk bruke originale data og vil relatere de ulike strukturer med de biologiske resultatene basert på forskjellige dimensjoner , med den mest betydningsfulle vesen i den første beregnede komponent .
Comparative Molecular Feltet Analyse

Denne versjonen av QSAR tar delvis minste kvadraters analyse sammen med kryssvalidering for å lage prognoser for den biologiske aktiviteten . I denne type metodikk , vil forskeren tilordne bestemte regler for justering av molekylstrukturen . Hver av molekylene er passe inn i et rutenett , og deretter ulike interaksjoner er beregnet basert på samhandling fra en sonde atom til de ulike nett . Det er mange forskjellige ligninger som kan resultere . I motsetning til andre typer regresjon , produserer dette ligninger der det er langt flere parametere enn mulige forbindelser
Apex - . 3D

Apex - 3D bruker et system som automatisk velger den beste justering og konformasjon for strukturene basert på den nødvendige biologiske respons fra tidligere eksperimenter. Det er mulig å finne effekten av forskjellige bindings orientering, antagonist -aktivitet versus agonistiske aktiviteten og virkningen av forskjellige reseptorer. Dette genererer 2D og 3D topografiske matriser og kan generere informasjon for par av molekyler snarere enn enkle molekyler .
Genetisk Funksjon Tilnærming

Genetisk funksjon tilnærming brukes når det er få prøvene og mange forskjellige variabler som undersøkes , og når datasettene ikke har lineære sammenhenger . Dette bruker beste karakter modeller og verste karakter modeller beregnet fra rådata . Det bygger bedre og bedre kvalitet modeller ved å bytte ut de verste karakter modeller . De mange forskjellige flere anfall blir deretter gitt til forskeren, som deretter velger den endelige modellen . Likhetene mellom modellene er studert for å gi informasjon om de strukturelle og biologiske sammenhenger .