Stamcellene som lager nye celler for å beskytte tarmene befinner seg i bunnen av kryptene til Lieberkühn, som er små, fingerlignende fremspring som kler tynntarmen og tykktarmen. Disse stamcellene kalles kryptbase-søyleceller (CBC) og er ansvarlige for å produsere de ulike celletypene som utgjør tarmslimhinnen, inkludert enterocytter (absorberende celler), begerceller (slimutskillende celler), Paneth-celler (antimikrobielt peptid- utskillende celler), og enteroendokrine celler (hormonutskillende celler). CBC deler seg stadig for å produsere nye celler som migrerer opp krypten og differensierer til de forskjellige typene tarmceller. Denne prosessen med cellefornyelse, kjent som tarmepitelcelleomsetning, er avgjørende for å opprettholde integriteten og funksjonen til tarmslimhinnen.
