En vaksine administrert i nesehulen vil ikke være for å beskytte reproduksjonskanalen, men snarere luftveiene. Nesehulen er en del av luftveiene, og vaksiner levert gjennom nesen er målrettet mot slimhinneimmunitet i de øvre luftveiene (inkludert nesehulen, munnen og svelget). Slimhinneimmunitet spiller en avgjørende rolle for å forhindre eller redusere alvorlighetsgraden av luftveisinfeksjoner.
Ved å introdusere vaksinen i nesehulen, kan immunsystemet i luftveiene gjenkjenne og utvikle en målrettet immunrespons mot den målrettede sykdommen eller patogenet. Imidlertid er vaksiner administrert i nesehulen vanligvis ment å beskytte mot sykdommer som primært påvirker luftveiene, ikke reproduksjonskanalen.