Bildeforvrengning: Røntgenstråler kan forvrenge bilder på grunn av forstørrelse og spredning. Dette er spesielt problematisk i bløtvev der det ikke er mye detaljer til å begynne med.
Ioniserende stråling: Røntgenstråler bruker ioniserende stråling. Dette betyr at de har nok energi til å slå elektroner av atomer, noe som kan skade DNA og forårsake flere helseproblemer, inkludert kreft. Som et resultat holdes røntgenavbildning på et minimum.
Mangel på farger og detaljer: Røntgenbilder gir begrenset informasjon når det kommer til subtile vevsforskjeller og kan overse strukturer som har samme tetthet som vevet rundt.