Økologisk kollaps :Avskoging og jorderosjon på grunn av overbefolkning og intensivt landbruk kan ha ført til en nedgang i jordbrukets produktivitet, noe som forårsaket matmangel og hungersnød.
Tørke og klimaendringer :Langvarig tørke og endringer i klimamønstre kan ha forstyrret landbruksproduksjonen og vannforsyningen, ført til matmangel og sosial uro.
Krigføring og politisk ustabilitet :Copán var involvert i flere konflikter med nabobystater fra Maya, noe som kan ha svekket byen og bidratt til dens tilbakegang. Intern politisk ustabilitet og maktkamper kunne ha forverret situasjonen ytterligere.
Handelsavbrudd :Endringer i handelsruter og nedgangen i langdistansehandelsnettverk kan ha påvirket Copáns økonomi, og ført til tap av rikdom og ressurser.
Sykdom og epidemier :Spredning av sykdommer og epidemier, som gul feber eller malaria, kunne ha desimert befolkningen og svekket byens evne til å opprettholde seg selv.
Det er viktig å merke seg at dette bare er teorier, og de eksakte årsakene til Copáns kollaps diskuteres fortsatt blant forskere. Det var sannsynligvis en kombinasjon av flere faktorer som førte til byens tilbakegang og til slutt forlatelse.