Historisk sett ble hemofili videre klassifisert i to primærtyper basert på den spesifikke koagulasjonsfaktormangelen som er ansvarlig for blødningsforstyrrelsen. Hemofili A ble funnet å skyldes mangel på koagulasjonsfaktor VIII, mens hemofili B var preget av mangel på koagulasjonsfaktor IX. Disse undertypene avklarte ytterligere de distinkte genetiske mutasjonene som er ansvarlige for hver type hemofili. I dag er begrepene hemofili A og hemofili B mer vanlig brukt for å referere til disse blødningsforstyrrelsene i stedet for det brede begrepet "hemofili".