Under en trombektomi lages et lite snitt og et tynt, fleksibelt rør med et lite kamera på enden (et kateter) føres inn i blodåren. Dette gjør at legen kan se plasseringen av blodproppen. Når blodproppen er funnet, kan legen bruke en rekke verktøy for å fjerne den, for eksempel en ballong, laser eller stent. En annen prosedyre er å bruke trombolytiske medisiner som løser opp koagelen ved å konvertere inaktivt plasminogen i koaguleringen til enzymet plasmin, et effektivt koageloppløsende stoff. Noen trombolytika inkluderer alteplase (Activase), streptokinase (Streptase) og urokinase (Abbokinase).
Trombektomi er en alvorlig medisinsk prosedyre, men mesteparten av tiden er vellykket og kan bidra til å løse både akutte symptomer som følge av blodpropp så vel som langsiktige komplikasjoner.