Imidlertid har ryggmargen en viss grad av autonomi, kjent som ryggmargsreflekser. Dette er ufrivillige, raske reaksjoner på stimuli som oppstår på nivå med ryggmargen uten å kreve bevisst tanke eller prosessering av hjernen. Eksempler på ryggmargsreflekser inkluderer kne-jerk-refleksen og tilbaketrekningsrefleksen, hvor en persons ben automatisk rykker bort fra en smertefull stimulans. Disse refleksene er avgjørende for å beskytte kroppen mot skade og bevare grunnleggende motoriske funksjoner.
Dessuten er ryggmargen ansvarlig for å overføre sensorisk informasjon fra kroppen til hjernen og motoriske kommandoer fra hjernen til musklene. Dette gir mulighet for koordinering av bevegelse og sensorisk prosessering, selv om behandlingen av kompleks sensorisk informasjon og beslutningstaking vil kreve involvering av hjernen.
Totalt sett, mens ryggmargen kan utføre visse reflekser og overføre signaler, er den avhengig av hjernen for funksjoner på høyere nivå og generell kontroll over kroppens bevegelser og sensasjoner.