Hovedforskjellen mellom vener og arterier er tilstedeværelsen av klaffer i vener. Ventiler er enveisklaffer som hindrer blod i å strømme bakover. Dette er viktig fordi venene ofte er plassert under hjertet, og uten klaffer ville blodet samle seg i venene og ikke kunne returnere til hjertet.
Arterier har ikke klaffer fordi blod pumpes gjennom dem ved sammentrekning av hjertet. Det høye trykket i blodet i arteriene holder det i bevegelse fremover, selv mot tyngdekraften.
I tillegg til klaffer har vener også tynnere vegger enn arterier. Dette er fordi årer ikke trenger å tåle like mye trykk som arterier. Det høye trykket i arteriene er nødvendig for å pumpe blod gjennom kroppen, men vener trenger ikke å generere noe trykk.
Til slutt er venene ofte plassert nærmere overflaten av huden enn arterier. Dette er grunnen til at årer ofte er synlige på huden, mens arterier ikke er det.