Øyefarge bestemmes av mengden og fordelingen av melanin i iris. Melanin er et pigment som også gir hud og hår fargen. Personer med mer melanin har en tendens til å ha mørkere øyne, mens personer med mindre melanin har en tendens til å ha lysere øyne.
Det er mange forskjellige faktorer som kan påvirke øyefarge, inkludert genetikk, etnisitet og miljøfaktorer som soleksponering. Imidlertid spiller genetikk den viktigste rollen for å bestemme øyenfarge.
Genene for øyenfarge er lokalisert på kromosom 15. Det er to hovedgener som bestemmer øyenfarge:OCA2-genet og HERC2-genet. OCA2-genet koder for et protein som er involvert i produksjonen av melanin. HERC2-genet koder for et protein som er involvert i reguleringen av OCA2-genet.
Variasjoner i disse genene kan føre til forskjellige øyenfarger. For eksempel vil personer med to kopier av den brunøyede allelen (OCA2-B) ha brune øyne. Personer med en kopi av den brunøyede allelen (OCA2-B) og en kopi av den blåøyede allelen (OCA2-b) vil ha hasselbrune eller grønne øyne. Og personer med to kopier av den blåøyde allelen (OCA2-b) vil ha blå øyne.
I tillegg til genetikk kan også andre faktorer som etnisitet og miljøfaktorer påvirke øyefargen. For eksempel har mennesker av afrikansk avstamning en tendens til å ha mørkere øyne enn mennesker av europeisk avstamning. Og folk som bor i solrikt klima har en tendens til å ha lysere øyne enn folk som bor i overskyet klima.
Modal øyenfarge er ganske enkelt den hyppigst forekommende øyenfargen i en gitt populasjon. Det bestemmes av en kombinasjon av genetiske, etniske og miljømessige faktorer.