Blue marlin er trygt å spise og bærer vanligvis ikke giftstoffer som er farlige for mennesker gjennom konsum. Imidlertid kan visse omstendigheter føre til tilfeller av ciguatera-fiskforgiftning ved inntak av blå marlin på grunn av akkumulering av naturlig forekommende giftstoffer fra inntak av annen mindre fisk. Derfor er det avgjørende å forstå retningslinjene for mattrygghet og skaffe blå marlin fra anerkjente kilder for å unngå potensielle risikoer.