Det er ingen spesifikk plassering på kromosomene der Crohns sykdom er lokalisert. Crohns sykdom er en kompleks genetisk lidelse som skyldes interaksjoner mellom flere genetiske variasjoner og miljøfaktorer. Mens flere genetiske varianter assosiert med Crohns sykdom er identifisert, er de spredt over forskjellige kromosomer.