Pilonidale cyster har en høy grad av tilbakefall etter kirurgisk fjerning, med rapporterte tilbakefallsrater som varierer mye i medisinsk litteratur, men varierer generelt fra 10 % til 30 %. Visse faktorer som ufullstendig fjerning av hele kanalen eller sinus, dyp eller kompleks natur av cysten, dårlig sårheling, infeksjon, fedme eller overdreven hår i det berørte området kan øke risikoen for tilbakefall.