I nærvær av en hjerneabscess kan fjerning av CSF under en lumbalpunksjon raskt redusere trykket i ryggmargskanalen. Denne plutselige trykkendringen kan forårsake et skifte i hjernevevet, noe som fører til herniering. Herniering oppstår når hjernevev presses gjennom en naturlig åpning i skallen, som foramen magnum, hvor hjernen kobles til ryggmargen.
Hjerneprolaps er en medisinsk nødsituasjon og kan ha alvorlige konsekvenser, inkludert koma, permanente nevrologiske mangler eller til og med død. Derfor, for å unngå denne potensielle komplikasjonen, er en lumbalpunksjon kontraindisert hos pasienter med en mistenkt eller bekreftet hjerneabscess.