1. Fysisk barriere:
Pili kan fungere som en fysisk barriere som skjermer bakterieoverflaten fra direkte interaksjon med komponenter i immunsystemet, som antistoffer og fagocytiske celler. Ved å skape en fysisk separasjon mellom bakteriecellen og immuncellene, gjør pili det mer utfordrende for immunsystemet å gjenkjenne og målrette mot bakteriene.
2. Molekylær kamuflasje:
Noen pili viser en spesifikk molekylstruktur som gjør at de kan etterligne vertsglykoproteiner eller sialinsyrer. Denne egenskapen gjør det mulig for bakterier å unngå gjenkjennelse og målretting av immunsystemet. Ved å maskere seg som vertsmolekyler kan bakterier effektivt unngå fagocytose og komplementmediert drap.
Selv om pili kan gi en viss beskyttelse til bakterier, garanterer de ikke fullstendig immunitet mot immunsystemet. Vertens immunsystem kan fortsatt bruke andre mekanismer, for eksempel cellemediert immunitet, for å gjenkjenne og eliminere bakterier til tross for tilstedeværelsen av pili.