De aller fleste tilfeller av viral myokarditt forsvinner fullstendig, med gjenoppretting av normal hjertefunksjon. Prognosen er generelt god, og de fleste blir helt friske. Men i sjeldne tilfeller kan myokarditt føre til alvorlige komplikasjoner, som hjertesvikt, arytmier og plutselig hjertedød. Restitusjonstiden varierer avhengig av alvorlighetsgraden av infeksjonen og individets generelle helse. Mild myokarditt går vanligvis over i løpet av noen få uker, men mer alvorlige tilfeller kan ta flere måneder eller til og med et år å helbrede fullt ut.
