1) Patogene interaksjoner: Noen bakterier forårsaker sykdommer hos mennesker, som lungebetennelse, tuberkulose, kolera og matforgiftning.
2) Kommensale interaksjoner: Andre bakterier lever på eller i mennesker uten å forårsake skade. Disse bakteriene kan være involvert i fordøyelse, næringssyntese og beskyttelse mot skadelige patogener.
3) Gjensidige interaksjoner: Atter andre bakterier gir fordeler for mennesker. For eksempel hjelper noen bakterier mennesker med å fordøye mat, produsere antibiotika og kontrollere skadedyr.
4) Miljøinteraksjoner: Bakterier spiller viktige roller i miljøet. De hjelper til med å bryte ned organisk materiale, resirkulere næringsstoffer og fikse nitrogen fra atmosfæren.