Under latens eksisterer viruset i kroppen uten å indusere noen symptomer, men opprettholder fortsatt potensialet for reaktivering. Latensperioden kan variere i lengde, fra noen uker til flere år, avhengig av type virus. I løpet av dette stadiet er det virale genomet tilstede, men forblir i ro i vertscellene, primært bosatt i spesifikke vev eller organer. Immunsystemet kan være uvitende eller ute av stand til å fullstendig utrydde det latente viruset, noe som muliggjør dets utholdenhet i kroppen. Faktorer som utløser viral reaktivering kan inkludere svekket immunrespons på grunn av stress, aldring eller immunsuppressive forhold, noe som fører til gjenoppkomst av aktiv infeksjon.