1. Lysogeni: Virus-DNA forblir i dvale i vertscellens genom og produserer ingen nye virus. Vertscellen kan fungere normalt og viser kanskje ingen tegn på infeksjon.
2. Celletransformasjon: Integreringen av viralt DNA i vertscellens genom kan endre cellens genuttrykk og oppførsel. Dette kan føre til endringer i cellens metabolisme, vekst og differensiering. I noen tilfeller kan cellen bli kreft.
3. Profaginduksjon: Under visse forhold, som eksponering for UV-lys eller andre stressfaktorer, kan profagen induseres til å forlate den lysogene syklusen og gå inn i den lytiske syklusen. Dette kan føre til produksjon av nye virus og lysis (ødeleggelse) av vertscellen.
4. Immunitet mot superinfeksjon: Tilstedeværelsen av en profag i vertscellens genom kan gi immunitet mot superinfeksjon av andre relaterte virus. Dette er fordi vertscellen allerede har en kopi av virus-DNA, så det nye viruset kan ikke integrere sitt DNA og etablere en ny infeksjon.
De spesifikke effektene av et virus i den lysogene syklusen vil avhenge av typen virus og vertsorganismen.