For å diagnostisere en ovariecyste, må en lege utføre en bekkenundersøkelse og kan også bestille en ultralyd. En ultralyd er en smertefri prosedyre som bruker lydbølger til å lage bilder av eggstokkene. Dette kan hjelpe legen med å identifisere eventuelle cyster og bestemme deres størrelse og plassering.
Hvis en ovariecyste er stor eller forårsaker symptomer, må den kanskje fjernes. Dette kan gjøres kirurgisk eller gjennom en ikke-kirurgisk prosedyre kalt laparoskopisk kirurgi. Laparoskopisk kirurgi er en minimalt invasiv prosedyre som innebærer å lage noen få små snitt i magen og bruke et kamera for å styre instrumentene.