Lymfeknutene består av lymfoidvev, som er en type bindevev som inneholder et stort antall lymfocytter, makrofager og andre immunceller. Lymfeknutene er omgitt av en kapsel av bindevev, og de er delt inn i to hovedrom:cortex og medulla. Cortex er det ytre rommet til lymfeknuten, og det inneholder lymfoidfolliklene. De lymfoide folliklene er små, runde strukturer som inneholder et stort antall lymfocytter. Medulla er det indre rommet i lymfeknuten, og den inneholder margstrengene. Medullærstrengene er tråder av bindevev som forbinder lymfoidfolliklene.