Endetarmen er tett innervert av nerver fra den sakrale ryggmargen, spesielt fra S2-S4-segmentene. Hovednervetilførselen til endetarmen er levert av nerven pudendal, som oppstår fra sakral plexus. Andre nerver som bidrar til innervering av endetarmen inkluderer bekken splanchnic nerver og inferior rektale nerver. Disse nervene gir sensorisk, motorisk og autonom innervering til endetarmen, slik at den kan fungere ordentlig og reagere på ulike stimuli.