Desinfeksjon er en prosess for å eliminere nesten alle patogene mikroorganismer, unntatt bakteriesporer, på livløse gjenstander og overflater. Desinfeksjon dreper ikke nødvendigvis alle mikroorganismer, spesielt resistente bakteriesporer; det er mindre grundig enn sterilisering, som har som mål å ødelegge alle typer liv. Mange desinfeksjonsmetoder er effektive mot de fleste anerkjente patogener, men mislykkes mot enkelte mikroorganismer som prioner.
Eksempler på desinfeksjon inkluderer kokende vann, alkohol, UV-lys og kjemiske midler som blekemiddel. I motsetning til fullstendig eliminering av mikroorganismer oppnådd med steriliseringsprosesser, er desinfeksjon generelt ineffektiv mot bakteriesporer.
