Utskillelsesorganet til en fugl kalles nyren. Fugler har to nyrer, som er plassert i bukhulen, nær ryggraden. Nyrene er ansvarlige for å regulere balansen av væsker og elektrolytter i kroppen, og for å fjerne nitrogenholdige avfallsstoffer fra blodet. Hos fugler produserer nyrene urin, som deretter transporteres til cloacaen, hvor den blandes med avføring og til slutt støtes ut.