Den delen av hjernen som inkluderer thalamus, hypothalamus og epithalamus kalles diencephalon. Diencephalon er en av de fem hovedavdelingene i hjernen og ligger i sentrum. Den ligger mellom storhjernen og hjernestammen. Thalamus er en stor masse grå substans som fungerer som et relésenter for sensoriske og motoriske signaler. Det spiller også en rolle i bevissthet, søvn og hukommelse. Hypothalamus er en liten struktur som ligger under thalamus og er ansvarlig for å regulere mange av kroppens funksjoner, inkludert temperatur, sult, tørste, søvn og reproduksjon. Epithalamus er en liten region som ligger over thalamus og er involvert i produksjonen av cerebrospinalvæske.