Antistoffer binder seg til antigener som finnes på overflaten av patogener, og forhindrer derved deres inntreden i vertsceller. I tilfeller der antistoffer alene ikke effektivt kan nøytralisere patogener, aktiveres komplementsystemet som er nært assosiert med antistoffer. Aktivering av komplementsystemet resulterer i lysis (brudd) av patogener. Antistoffer gir derfor både direkte og indirekte forsvarsmekanismer.
