Botulisme påvirker nervesystemet, spesielt de nevromuskulære knutepunktene der nerver kobles til muskler. Det forstyrrer overføringen av signaler fra nervene til musklene, noe som fører til muskelsvakhet og potensielt lammelse. Dette kan ha dype effekter på pust, bevegelse og andre kroppsfunksjoner.