Ikke alle flått bærer borreliose. Bare visse arter av flått kan overføre bakteriene som forårsaker borreliose, og selv innenfor disse artene er bare en liten prosentandel av flåtten faktisk infisert. Flåtten som oftest er assosiert med borreliose er svartbeint flått (Ixodes scapularis) i det østlige USA og vestlig flått (Ixodes pacificus) i det vestlige USA. Andre flåttarter som kan overføre borreliose inkluderer den ensomme stjerneflåtten (Amblyomma americanum) og den amerikanske hundeflåtten (Dermacentor variabilis).
Det er viktig å merke seg at ikke alle bitt fra en infisert flått vil resultere i borreliose. Sannsynligheten for å utvikle borreliose avhenger av faktorer som flåttens art, bittets varighet og individets immunrespons.