Under karantene er folk vanligvis pålagt å oppholde seg i et angitt område og unngå kontakt med andre. Dette kan bety å bo hjemme, på et hotell eller på sykehus. Dyr kan settes i karantene på lignende måte, eller de kan holdes i et eget område på gården eller i en dyrehage. Varer kan også settes i karantene, for eksempel mat, planter og dyr, som er mistenkt for å bære sykdommer eller skadedyr.
Karantener kan være en svært effektiv måte å hindre spredning av sykdom på. Imidlertid kan de også være forstyrrende og dyre. Som sådan brukes de vanligvis bare når det er høy risiko for overføring av en alvorlig sykdom.