Væsken som finnes i skjoldbruskkjertelcyster er vanligvis en klar eller stråfarget væske som kan være tynn og vannaktig, eller tykkere og mer viskøs. Det kan noen ganger ha en brunaktig eller rødlig skjær på grunn av tilstedeværelsen av blod eller hemosiderin (et nedbrytningsprodukt av hemoglobin). Væsken kan også inneholde protein, kolesterol og andre cellulære komponenter. I noen tilfeller kan cystevæsken være grumsete eller grumsete på grunn av tilstedeværelsen av inflammatoriske celler eller rusk.
