Mageslimhinnen er dekket av et slimlag som fungerer som en barriere mot HCl og andre fordøyelsessafter. Slimet produseres av spesialiserte celler i magen som kalles slimceller.
Magen produserer også bikarbonationer (HCO3-) som bidrar til å nøytralisere HCl. Bikarbonationer produseres av parietalcellene i magen.
I tillegg blir mageslimhinnen stadig erstattet av nye celler. Denne prosessen, kalt celleomsetning, hjelper til med å reparere eventuelle skader som er forårsaket av HCl.
Som et resultat av disse beskyttelsesmekanismene er magen i stand til å motstå de etsende effektene av HCl og andre fordøyelsessafter.