Under en tarmreseksjon vil kirurgen gjøre et snitt i magen og fjerne den berørte delen av tarmen. De resterende delene av tarmen vil deretter kobles sammen igjen. I noen tilfeller kan en kolostomi eller ileostomi være nødvendig. En kolostomi er en åpning i tykktarmen som lar avføring passere ut av kroppen gjennom en stomi. En ileostomi er en åpning i ileum som lar avføring passere ut av kroppen gjennom en stomi.
Tarmreseksjon er en stor operasjon, og pasienter vil vanligvis trenge å bli på sykehuset i flere dager etter inngrepet. Restitusjonstiden kan variere avhengig av individet, men de fleste er i stand til å gå tilbake til sine normale aktiviteter innen noen få uker.