Eter utøver sin effekt på nerveaktivitet primært på stedet for de nevrotransmitter-gatede ionekanalene, som er ansvarlige for den raske eksitabiliteten til nervecellene. Spesifikt virker eter på gamma-aminosmørsyre (GABA) reseptorene, og forårsaker en økning i den hemmende kloridionetilstrømningen. Dette fører til hyperpolarisering eller mindre eksitable nerveceller, noe som resulterer i de beroligende og anestetiske effektene av eter. Disse endringene kan modifisere signaloverføringsdynamikken på tvers av nevronale nettverk, noe som fører til de karakteristiske endringene i bevissthet, persepsjon, bevegelse og følelse under eteranestesi.
