Tynntarmen er ansvarlig for å bryte ned store, komplekse molekyler til mindre, absorberbare molekyler. Dette gjøres gjennom mekanisk fordøyelse, kjemisk fordøyelse og absorpsjon. Mekanisk fordøyelse innebærer fysisk å bryte ned mat i mindre biter gjennom tygging, muskelsammentrekninger og virkningen av galle. Kjemisk fordøyelse innebærer bruk av enzymer for kjemisk å bryte ned karbohydrater, proteiner og fett til enklere molekyler. Absorpsjon er prosessen der disse enklere molekylene tas opp i blodet gjennom veggene i tynntarmen.