Rørene inne i nyrene kalles
nefroner . Hver nyre inneholder millioner av nefroner, som er de funksjonelle enhetene til nyrene. Hvert nefron består av et nyrekorpuskel (som inkluderer glomerulus og Bowmans kapsel) og en nyretubuli. Nyretubuli er et langt, kveilet rør som fører fra nyrelegemet til samlekanalen. Samlekanalene samler urin fra nefronene og fører den til nyrebekkenet, som er det sentrale hulrommet i nyren.