Lungene er det primære stedet for tuberkuloseinfeksjon i luftveiene. Tuberkulose påvirker spesifikt alveolene, som er de små luftsekkene i lungene som er ansvarlige for gassutveksling. Bakteriene som forårsaker tuberkulose, Mycobacterium tuberculosis, kommer inn i lungene gjennom inhalerte dråper og etablerer infeksjon i alveolene.