Det første ebolavirusutbruddet skjedde i 1976 i det som nå er Den demokratiske republikken Kongo (tidligere Zaire). Utbruddet skjedde i en landsby nær Ebola-elven, som ga viruset navnet. Det andre utbruddet skjedde i det som nå er Sør-Sudan, også i 1976. Siden den gang har det vært flere utbrudd av ebolavirussykdom i Afrika.