Den vanligste formen for pest var byllepesten, som ble forårsaket av bakterien Yersinia pestis. Denne formen for pesten var preget av hovne lymfeknuter, eller buboer, som ofte dukket opp i lysken, armhulene eller nakken. Andre symptomer inkluderte feber, frysninger og oppkast. Byllepesten var ofte dødelig, med en dødelighet på rundt 50 %.