Røntgenstråler kan skade DNA, noe som potensielt kan føre til mutasjoner. Selv om risikoen er lav, er det fortsatt en potensiell ulempe ved å bruke røntgenstråler. For eksempel har et enkelt røntgenbilde av brystet en svært liten risiko for å forårsake kreft. Imidlertid kan gjentatte røntgenstråler, som de som brukes i visse medisinske prosedyrer, øke denne risikoen.
For å minimere risikoen for DNA-skade fra røntgen, tar leger forholdsregler som å bruke lavest mulig stråledose og skjerme sensitive områder av kroppen.